Varian virus SARS-CoV-2 B.1.1.529, atau Omicron, pertama kali dilaporkan ke WHO pada tanggal 24 November 2021. Varian ini sangat cepat menyebar, dan WHO mengkategorikannya sebagai Variant of Concern (VoC) 2 hari setelah dilaporkan.
Varian Omicron memiliki jumlah mutasi yang sangat banyak, di antaranya ditemukan lebih dari 30 mutasi pada bagian spike virus. Sebanyak 15 mutasi ditemukan di bagian spike yang bernama receptor-binding domain (RBD), area yang berikatan dengan reseptor angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2). Beberapa mutasi yang terjadi terbukti meningkatkan infektivitas virus dan kemampuan virus untuk menghindar dari imun tubuh.
Protein S (spike) merupakan target dari hampir seluruh antibodi penetral (neutralizing antibody/NAb) yang ditemukan pada plasma konvalesen ataupun yang dihasilkan oleh vaksin. Antibodi penetral bekerja dengan cara berikatan dengan patogen dan menetralkan patogen tersebut sehingga tidak lagi dapat menginfeksi sel. Sebuah studi yang dilakukan di Peking University, Beijing, melaporkan bahwa varian Omicron dapat menghindari 85% jenis antibodi penetral yang diuji. Hal ini menunjukkan bahwa varian Omicron dapat menyebabkan penghindaran imunitas humoral yang signifikan dan potensi pergeseran antigenik. Beberapa obat-obatan NAb juga mengalami penurunan kemampuan dalam menetralkan virus.
Suatu studi melakukan pengujian terhadap 247 NAb anti-RBD manusia dan mendapatkan bahwa NAb banyak berkelompok di enam (A-F) kelompok epitope (epitope: area pada virus tempat menempel dengan sel B atau antibodi). Varian Omicron dapat lolos dari sebagian besar NAb pada kelompok epitope A-D, dan juga beberapa pada epitope E dan F. Untuk mengembangkan vaksin dan obat NAb yang efektif dalam melawan varian Omicron, harus dilakukan analisis terhadap masing-masing kelompok NAb.
Sampai saat ini, sejumlah besar NAb anti-RBD SARS-CoV-2 telah diidentifikasi dari pasien yang sembuh dan yang divaksin. NAb paling kuat sering ditemukan di kelompok A-D yang cenderung secara langsung menghambat pengikatan pada reseptor ACE2. Namun demikian, kekuatan penetralisir NAb ini sering dikalahkan oleh mutasi RBD dalam pertarungan antara SARS-CoV-2 dan kekebalan humoral manusia. Data memang menunjukkan bahwa Omicron akan lolos dari sebagian besar NAb SARS-CoV-2, namun, kelompok NAb E dan F kurang terpengaruh oleh Omicron, kemungkinan karena jumlah mereka tidak berlimpah dalam populasi sehingga tidak banyak memberikan tekanan pada RBD untuk berevolusi pada kelompok epitope tersebut. NAb kelompok ini (E dan F) menargetkan wilayah RBD yang terlindungi dari mutasi pada sarbecovirus (subgenus virus SARS-related coronavirus) dan karenanya merupakan target ideal untuk pengembangan obat NAb pan-sarbecovirus di masa depan.
Simpulan:
Pada varian Omicron (B.1.1.529) ditemukan lebih dari 30 mutasi, 15 di antaranya terdapat di receptor-binding domain (RBD) pada spike virus. Mutasi tersebut menyebabkan Omicron dapat menghindar dari antibodi penetral (NAb) yang dihasilkan setelah infeksi alami ataupun dari vaksin. Untuk mengembangkan vaksin dan obat antibodi penetral (NAb) yang efektif terhadap Omicron perlu menarget area pada RBD virus yang tidak mengalami mutasi, yaitu pada epitope E dan F.
Gambar: Ilustrasi (kjpargeter - www.freepik.com)
Referensi:
Cao Y, Wang J, Jian F, Xiao T, Song W, Yisimayi A, et al. Omicron escapes the majority of existing SARS-CoV-2 neutralizing antibodies. Nature [Internet]. 2021. Available from: https://www.nature.com/articles/d41586-021-03796-6
